Proces fermentacije mikroorganizama u dubokom rezervoaru naziva se fermentacija dubokog rezervoara. Razvio ga je prije 50 godina NCAUR, koji je kasnije lansirao arsenal antibiotika protiv ljudskih bolesti. Jackson i njegove kolege su poboljšali tu tehnologiju razvijajući recepte za fermentaciju koji su bili efikasniji od prethodnih recepata. Njihov rad je poboljšao masovnu proizvodnju spora P. fumosoroseus. Sada ih žele koristiti na terenu.
Da bi proizvele velike količine penicilina, Sjedinjene Države i Ujedinjeno Kraljevstvo su se obratile najvećim hemijskim i farmaceutskim kompanijama u Sjedinjenim Državama. Pfizer je uspio proizvesti velike količine penicilina fermentacijom u dubokom rezervoaru i do kraja rata penicilin je bio široko dostupan savezničkim vojnicima. Danas je fermentacija u dubokom rezervoaru najrasprostranjenija metoda za farmaceutsku proizvodnju. Međutim, još uvijek postoje mnoga ograničenja za ovu metodu fermentacije. Neefikasna površinska fermentacija je nezgodna za velike količine proizvodnje.
Kako bi napravili velike količine penicilina, Pfizerovi istraživači su prvo primijenili ovu tehniku aseptične fermentacije u proizvodnji limunske kiseline. Kako je tehnologija postajala sve rafiniranija, bilo je moguće povećati čistoću i moć penicilina. Konačno, eksperiment Jaspera Kanea pokazao je da je fermentacija u dubokom rezervoaru efikasan način za proizvodnju velikih količina antibiotika penicilina. Pfizeru su bili potrebni ogromni rezervoari za fermentaciju da bi mogao proizvesti antibiotik u velikim razmjerima. Na sreću, Pfizer je preuredio staru fabriku leda u Bruklinu u fabriku penicilina.
Pfizerovi naučnici za penicilin teško su radili s kalupom koji ga uzrokuje da proizvodi visokokvalitetan proizvod. Metode površinske fermentacije su sklone kontaminaciji, što rezultira niskim prinosima. Kada je Kane predložio fermentaciju u dubokom rezervoaru, naišao je na neodoljiv odgovor. On je predložio ovu metodu, ali je kompanija morala da žrtvuje nekoliko profitabilnih proizvoda kako bi bila komercijalno održiva. Ovo je bio rizičan prijedlog za Pfizer i zahtijevao bi ukidanje drugih proizvoda.
U laboratoriji, istraživači su sintetizirali penicilin koristeći penicilin kalup koji prirodno proizvodi antibiotik penicilin. Kalup se uzgaja u dubokom rezervoaru za fermentaciju koristeći šećer i druge sastojke. Kao rezultat toga, antibiotik se proizvodi i obnavlja na kraju fermentacije. Međutim, još uvijek nije jasno da li je fermentacija u dubokom rezervoaru bolji način za stvaranje antibiotika. Međutim, to je korisna tehnika za bioproizvodnju antibiotika.
Pfizerova pilot fabrika po Currie-ovom metodu osnovana je 1919. Limunska kiselina proizvedena ovom metodom bila je mnogo veća od količine dobivene iz agruma. Proces je u početku bio neuspešan, ali je na kraju dao dovoljno visok da je Pfizer počeo da ga primenjuje na druge proizvode. Ovaj proces je razvijen u dubokim rezervoarima, što je omogućilo Pfizeru da proizvodi limunsku kiselinu efikasnije nego ikad. Nedugo prije nego što je tehnologija fermentacije nadmašila proizvodnju na bazi agruma.